根据市委、市人民政府《关于中共怀化市委、怀化市人民政府机构设置的通知》（怀发[2001]4号）和《关于印发〈关于怀化市机构改革方案的实施意见〉的通知》（怀发[2001]6号）精神，设置怀化市卫生局。市卫生局是主管全市卫生工作的市人民政府工作部门，它的主要职责为：
    （一）贯彻党和国家卫生工作的方针、政策和法律、法规、规章，研究提出卫生事业战略目标和发展规划，监督实施国家技术规范和卫生标准。
    （二）研究提出区域卫生规划，统筹规划与协调全市卫生资源配置；制订社区卫生服务发展规划和服务标准，指导卫生规划的实施。
    （三）实施农村卫生、妇幼卫生工作规划和政策措施，指导初级卫生保健规划和母婴保健专项技术的实施。
    （四）贯彻预防为主方针，开展全民健康教育落实国家对人群健康危害严重疾病的防治规划；组织对重大疾病的综合防治。
    （五）研究指导医疗机构改革，监督实施医务人员执业标准、医疗质量标准和服务规范。
    （六）依法监督管理采供血及临床用血质量。
    （七）研究拟定全市重点医学科技发展规划，组织重点医学卫生科研课题的协作攻关，指导医学科技成果的普及应用工作。
    （八）依法监督管理传染病、地方病、职业病防治和食品、职业、环境、放射、学校卫生，监督实施食品、化妆品质量管理规范并负责认证工作。
    （九）组织实施国家卫生机构编制标准和卫生技术人员资格认定标准，拟定并组织实施全市卫生人才发展规划和卫生人员的职业道德规范。
    （十）组织指导医学卫生方面的政府与民间的多边、双边合作交流及卫生援外工作，参与国际组织倡导的重大卫生活动。
    （十一）贯彻中西医并重的方针，推进中西医的继承与创新、实现中西医现代化。
    （十二）拟定全市爱国卫生和农村改水改厕工作规划、政策和措施并组织实施；协调有关部门搞好城乡爱国卫生工作。
    （十三）负责市保健委员会确定的保健对象的医疗保健工作，按照规定管理有关干部的医疗工作。
    （十四）组织调度全市卫生技术力量，协助市县人民政府和有关部门对重大突发疫情、病情实施紧急处置。防止和控制疫情、疾病的发生、蔓延。
    （十五）承办市委、市政府交办的其他事项。